制藥廠在生產產品的過程當中，面對不同類型的產品，需要保障不同潔凈級別的生產環境標準，而不同潔凈級別的生產環境標準主要的不同就是需要對生產環境的粒子數量以及微生物數量進行嚴格等級不同的檢測和控制。
因此，工作人員需要采取各種方法來對潔凈室進行消毒滅菌工作以達到標準要求，使用的消毒劑也是多種多樣，現在市面上的殺孢子劑多種多樣，制藥廠需要找到一款適合自己的殺孢子劑，才能夠對癥下藥，事半功倍。
下潔凈區消毒滅菌常用消毒劑的優缺點：
1、酚類消毒劑
優點：
對分枝桿菌（結核桿菌）有效（其他的醇類和季銨鹽類不具備）、廣譜消毒劑，具有堿性或酸性配方（添加堿性成分的時候，酚類消毒劑會變成陰離子型表面活性劑，可以使酚類消毒劑具有良好的去污能力，在高有機物濃度下，依然不受有機物的干擾，能夠發揮良好的殺滅效果）（歡迎免費注冊，登陸中國涂料在線（涂料在線）行業門戶網址www.zx446.com，免費發布供求，免費發布產品，免費發布企業動態）。
局限：
不能殺孢子、有殘留、使用不兼容化學品后活性受影響。
2、季銨鹽類消毒劑
優點：
具有廣譜活性（比酚類的略窄），殺菌劑毒性小，殺菌效率高，受 pH值變化的影響小，使用方便，化學性能穩定，分散作用及緩蝕作用好。
局限：
不能殺孢子，易受水硬度及有機物影響；長期單獨使用，易產生抗藥性,屬低效消毒劑。
3、醇類（70%異丙醇殺菌性能、75%乙醇殺病毒性能）
優點：
無殘留，廣譜容易揮發，不能殺孢子。
局限：
清潔效果差，可燃（安全性巨大的隱患），接觸時間有限（因為接觸時間有限，所以殺滅能力偏低，只能覆蓋到真菌孢子以下）。
4、殺孢子劑：
局限：腐蝕軟金屬和不銹鋼，要求預先清潔，對溫度和光敏感，可能產生氯氣存在安全隱患，對眼睛和皮膚有腐蝕性。
過氧化氫，6%濃度的過氧化氫即具有殺滅孢子的作用，高效消毒劑，揮發速度快。
局限：需要較高的濃度，需要較長的接觸時間，對軟金屬有腐蝕性，需要進行稀釋，需要預先清潔，對溫度敏感，對眼睛和皮膚有腐蝕性。
過氧化氫/過氧乙酸混合物，快速、廣譜活性，可殺孢子，同效果相當的氧化劑相比腐蝕性小，對人員較安全，可自滅菌。
局限：對軟金屬有腐蝕性，需要預先清潔，對溫度敏感，刺激性氣味，為了提高混合物的穩定性可能會加入大量醋酸，濃縮型的混合物，在稀釋后要盡快使用，避免效力大幅下降。
甲醛/乙醛，廣譜活性（包括孢子)無腐蝕性，可以噴霧方式使用。
局限：需要激活，有機物存在時不穩定而會被滅活要求較長的接觸時間，對人的安全性有影響，可能需要中和殘留。需要注意的是殺孢子劑沒有清潔作用。